麝香鼠适应性很强，对温度、湿度要求并非十分严格，它们可以在南方多湿温暖、甚至高温炎热的地区落户，也可以在中国寒冷的东北、干旱的西北地区生存繁殖。麝香鼠住在湿地，包括池塘、湖、沼泽及河岸，因而得到"沼泽松鼠"的昵称。它们是很好的游泳者，在水中，它们用自己的尾巴推进。虽然它们像海狸，但它们的尾巴较海狸皮革般的尾巴小和瘦。它们出没于阿拉斯加、加拿大及北墨西哥。麝香鼠会在水源旁挖掘出很大的地道的系统，并在水底做一个入口。在沼泽，麝香鼠会用香蒲和泥来建造它们的巢穴，甚至输送食物的平台。住在海狸巢穴的麝香鼠也很常见。麝香鼠帮忙维持给予水生动物提供栖息地方的沼泽空地。

麝香鼠的形态虽适宜游泳和潜水，但在陆地上，却移动极不灵活，因此它们多在黄昏和夜晚活动。它们起居的水体，常出现被咬断后漂浮在水面的植物，在岸边它们通过的跑道附近，有20-30mm长的深绿色粪便，堆放成堆。